Phylum Cercozoa Cavalier-Smith, 1998
   Subphylum Filosa T. Cavalier-Smith & E.E.-Y. Chao, 2003
     Superclass Monadofilosa Cavalier-Smith, 1997 see Subphylum Monadofilosa Cavalier-Smith, 1997
       1 Class Sarcomonadea Cavalier-Smith, 1993
       2 Class Imbricatea T. Cavalier-Smith & E.E.-Y. Chao, 2003
       3 Class Thecofilosea T. Cavalier-Smith & E.E.-Y. Chao, 2003