Phylum Cercozoa Cavalier-Smith, 1998
   Subphylum Filosa T. Cavalier-Smith & E.E.-Y. Chao, 2003
     Superclass Monadofilosa Cavalier-Smith, 1997 see Subphylum Monadofilosa Cavalier-Smith, 1997
       Class Thecofilosea T. Cavalier-Smith & E.E.-Y. Chao, 2003
         1 Order Cryomonadida Cavalier-Smith, 1993
         2 Order Tectofilosida Cavalier-Smith, 2003