[organisms]
see Clade Biota Wagner 2004 [Wiemann, de Queiroz, Rowe, Planavsky, Anderson, Gogarten, Turner & Gauthier 2020]
Domain Bacteria Woese et al. 1990
1.1.1 Candidate phylum Lindowbacteria (RIF2) Anantharaman et al. 2016
1.1.2 Candidate phylum TM6
see Phylum Dependentiae Yeoh et al. 2016
1.2.1 Phylum Spirochaetes Garrity and Holt 2001
1.2.2.1.1.1.1.1.1.1.1 Phylum Alphaproteobacteria Garrity et al., 2006
1.2.2.1.1.1.1.1.1.1.2.1 Phylum Acidithiobacillia
1.2.2.1.1.1.1.1.1.1.2.2.1 Phylum Gammaproteobacteria Garrity et al., 2005
1.2.2.1.1.1.1.1.1.1.2.2.2.1 Candidate phylum Muproteobacteria (RIF23) Anantharaman et al. 2016
1.2.2.1.1.1.1.1.1.1.2.2.2.2 Phylum Betaproteobacteria Garrity et al., 2006
1.2.2.1.1.1.1.1.1.2 Phylum Zetaproteobacteria Emerson et al., 2007
1.2.2.1.1.1.1.1.2.1 Candidate phylum Lambdaproteobacteria (RIF24) Anantharaman et al. 2016
1.2.2.1.1.1.1.1.2.2 Phylum Epslionproteobacteria
see Phylum Epsilonproteobacteria Garrity et al., 2006
1.2.2.1.1.1.1.2.1 Phylum Chrysiogemetes
see Phylum Chrysiogenetes Garrity and Holt 2001
1.2.2.1.1.1.1.2.2 Phylum Deferribacteres Garrity and Holt 2001
1.2.2.1.1.1.2.1.1 Phylum [Deltaproteobacteria] Kuever et al., 2006
1.2.2.1.1.1.2.1.2 Candidate phylum Dadabacteria Hug et al. 2015
1.2.2.1.1.1.2.2.1.1.1 Candidate phylum Schekmanbacteria (RIF3) Anantharaman et al. 2016
1.2.2.1.1.1.2.2.1.1.2.1 [Candidatus] Entotheonella Schmidt et al. 2000
1.2.2.1.1.1.2.2.1.1.2.2 Phylum Nitrospinae Lücker et al. 2013
1.2.2.1.1.1.2.2.1.2 Phylum Nitrospirae Garrity and Holt 2001
1.2.2.1.1.1.2.2.2.1.1.1 Candidate phylum Fischerbacteria (RIF25) Anantharaman et al. 2016
1.2.2.1.1.1.2.2.2.1.1.2 Candidate phylum Aminicenantes Rinke et al. 2013
1.2.2.1.1.1.2.2.2.1.2 Phylum Acidobacteria Thrash and Coates 2012
1.2.2.1.1.1.2.2.2.2.1 Candidate phylum Rokubacteria Hug et al. 2015
1.2.2.1.1.1.2.2.2.2.2 Candidate phylum NC10
1.2.2.1.1.2.1.1.1.1.1 Candidate phylum Cloacamonetes
see Phylum Cloacimonetes Rinke et al. 2013
1.2.2.1.1.2.1.1.1.1.2 Candidate phylum Delongbacteria (RIF26) Anantharaman et al. 2016
1.2.2.1.1.2.1.1.1.2.1 Candidate phylum Marinimicrobia Rinke et al. 2013
1.2.2.1.1.2.1.1.1.2.2.1.1 [Genus] Caldithrix Miroshnichenko et al. 2003
1.2.2.1.1.2.1.1.1.2.2.1.2 Candidate phylum KSB1
1.2.2.1.1.2.1.1.1.2.2.2.1 Phylum Bacteroidetes Krieg et al. 2012
1.2.2.1.1.2.1.1.1.2.2.2.2.1 Phylum Chlorobi Iino et al. 2010
1.2.2.1.1.2.1.1.1.2.2.2.2.2 Phylum Ignavibacteria
see Phylum Ignavibacteriae Podosokorskaya et al. 2013
1.2.2.1.1.2.1.1.2.1 Candidate phylum WS3
see Phylum Latescibacteria Rinke et al. 2013
1.2.2.1.1.2.1.1.2.2.1.1.1 Candidate phylum Handelsmanbacteria (RIF27) Anantharaman et al. 2016
1.2.2.1.1.2.1.1.2.2.1.1.2.1.1 Candidate phylum TA06
1.2.2.1.1.2.1.1.2.2.1.1.2.1.2 Candidate phylum WOR3
1.2.2.1.1.2.1.1.2.2.1.1.2.2 Candidate phylum Eisenbacteria (RIF28) Anantharaman et al. 2016
1.2.2.1.1.2.1.1.2.2.1.2 Candidate phylum Zixibacteria Castelle et al. 2013
1.2.2.1.1.2.1.1.2.2.2.1.1 Candidate phylum Edwardsbacteria (RIF29) Anantharaman et al. 2016
1.2.2.1.1.2.1.1.2.2.2.1.2.1 Candidate phylum Raymondbacteria (RIF7) Anantharaman et al. 2016
1.2.2.1.1.2.1.1.2.2.2.1.2.2 Phylum Fibrobacteres Garrity and Holt 2012
1.2.2.1.1.2.1.1.2.2.2.2.1 Phylum Gemmatimonadetes Zhang et al. 2003
1.2.2.1.1.2.1.1.2.2.2.2.2 Candidate phylum Glassbacteria (RIF5) Anantharaman et al. 2016
1.2.2.1.1.2.1.2.1.1 Candidate phylum Poribacteria Fieseler et al. 2004
1.2.2.1.1.2.1.2.1.2 Candidate phylum BRC1
1.2.2.1.1.2.1.2.2 Phylum Dictyoglomi Patel 2012
1.2.2.1.1.2.2.1.1.1.1 Candidate phylum Coatesbacteria (RIF8) Anantharaman et al. 2016
1.2.2.1.1.2.2.1.1.1.2.1.1 Phylum Cyanobacteria (ex Stanier 1974) Cavalier-Smith 2002 - cyanobacteria
1.2.2.1.1.2.2.1.1.1.2.1.2 Candidate phylum Melainabacteria Wrighton et al. 2014
1.2.2.1.1.2.2.1.1.1.2.2.1 Candidate phylum WOR1
1.2.2.1.1.2.2.1.1.1.2.2.2 Candidate phylum Margulisbacteria (RIF30) Anantharaman et al. 2016
1.2.2.1.1.2.2.1.1.2.1.1 Phylum Actinobacteria Garrity and Holt 2001
1.2.2.1.1.2.2.1.1.2.1.2.1 Phylum Armatimonadetes Tamaki et al. 2011
1.2.2.1.1.2.2.1.1.2.1.2.2 Phylum Chloroflexi Garrity and Holt 2001
1.2.2.1.1.2.2.1.1.2.2 Phylum Firmicutes corrig. Gibbons and Murray 1978 (Approved Lists 1980)
1.2.2.1.1.2.2.1.2.1.1.1.1 Phylum Deinococcus-Thermus
1.2.2.1.1.2.2.1.2.1.1.1.2.1 Phylum Thermotogae Reysenbach 2001
1.2.2.1.1.2.2.1.2.1.1.1.2.2.1 Candidate phylum Calescamantes Rinke et al. 2013
1.2.2.1.1.2.2.1.2.1.1.1.2.2.2 Phylum Aquificae Reysenbach 2001
1.2.2.1.1.2.2.1.2.1.1.2 Candidate phylum Fraserbacteria (RIF31) Anantharaman et al. 2016
1.2.2.1.1.2.2.1.2.1.2.1 Phylum Fusobacteria Garrity and Holt 2012
1.2.2.1.1.2.2.1.2.1.2.2 Phylum Synergistetes Jumas-Bilak et al. 2009
1.2.2.1.1.2.2.1.2.2.1 Candidate phylum Riflebacteria (RIF32) Anantharaman et al. 2016
1.2.2.1.1.2.2.1.2.2.2 Candidate phylum Wallbacteria (RIF33) Anantharaman et al. 2016
1.2.2.1.1.2.2.2 Candidate phylum Atribacteria Rinke et al. 2013
1.2.2.1.2.1.1 Phylum Elusimicrobia Geissinger et al. 2010
1.2.2.1.2.1.2 Candidate phylum Firestonebacteria (RIF1) Anantharaman et al. 2016
1.2.2.1.2.2.1 Candidate phylum Omnitrophica Rinke et al. 2013
1.2.2.1.2.2.2.1 Phylum Planctomycetes Garrity and Holt 2001
1.2.2.1.2.2.2.2.1 Phylum Clamydiae
see Phylum Chlamydiae Garrity and Holt 2012
1.2.2.1.2.2.2.2.2.1 Phylum Verrucomicrobia Hedlund 2011
1.2.2.1.2.2.2.2.2.2 Phylum Lentisphaerae Cho et al. 2004
1.2.2.2 Candidate phylum Hydrogenedentes Rinke et al. 2013
2 Candidate phyla radiation Brown et al. 2015